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質(zhì)譜儀對蛋白質(zhì)研究來(lái)說(shuō)可謂是*,但是它們通常體積龐大,價(jià)格昂貴,局限于專(zhuān)門(mén)的實(shí)驗室。當下,生物醫學(xué)領(lǐng)域的下一個(gè)革命直指蛋白質(zhì)組學(xué)——對不同細胞類(lèi)型中表達的蛋白質(zhì)進(jìn)行大規模分析。盡管你的身體里每一個(gè)細胞似乎都攜帶相同的DNA,但不同細胞類(lèi)型的蛋白質(zhì)表達差異很大。此外,蛋白質(zhì)生產(chǎn)出來(lái)后會(huì )被修飾,添加其他東西影響其功能發(fā)揮。
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質(zhì)量
納米孔技術(shù)是一種可以提供分析單個(gè)分子的方法。之前的研究,荷蘭格羅寧根大學(xué)化學(xué)生物學(xué)副教授Giovanni Maglia實(shí)驗室表明生物納米孔可以用來(lái)測量代謝物和識別蛋白質(zhì)和肽。這些孔是結合在一個(gè)膜內的大蛋白結構,分子進(jìn)入或通過(guò)小孔時(shí),會(huì )引起穿過(guò)小孔的電流發(fā)生變化。Maglia解釋說(shuō),測量肽質(zhì)量的主要障礙是它們通過(guò)小生物孔的速度太快,以至于無(wú)法讀取。
制造更小的孔是一項挑戰。“孔是由許多單體組成的,因此我們初修改了這些單體之間的相互作用,但這沒(méi)起作用。將單體與構成膜的大量脂類(lèi)混合,反而形成的小孔比例更高,這讓Maglia團隊有了修改膜之間相互作用的思路。”
? 有史以來(lái)小的孔
然后,Maglia團隊制造出了漏斗狀的孔,在其狹窄的一端只有0.84納米,這是有史以來(lái)小的生物孔。“下一個(gè)挑戰是確保肽能通過(guò)孔,無(wú)論其化學(xué)成分如何,”Maglia解釋說(shuō)。“這些孔帶有負電荷,這是它們正常工作所必需的。”
? 分辨率
不同尺寸的納米孔的測量表明電流與肽通過(guò)的體積成線(xiàn)性關(guān)系。這些肽段的長(cháng)度從4到22個(gè)氨基酸不等。氨基酸丙氨酸和谷氨酸之間的差異可以在這個(gè)系統中檢出,這意味著(zhù)納米孔質(zhì)譜儀的分辨率大約是40道爾頓。“傳統質(zhì)譜儀的分辨率要好得多,但是我們能把它的分辨率提高到這種程度,它就已經(jīng)能在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中起作用了,”Maglia說(shuō)。“我們還有很多方法能繼續改進(jìn),比如用人工氨基酸設計納米孔,在溶液中使用不同離子,改變溫度等方法來(lái)降低噪音干擾。”
納米孔系統有幾個(gè)*的賣(mài)點(diǎn):測量單分子,商業(yè)已經(jīng)開(kāi)始推廣,而且價(jià)格相對便宜;便攜,好處不言而喻;可拓展,允許設備使用不同的孔,您可以同時(shí)測量不同大小的肽甚至肽修飾。所有的一切都說(shuō)明,多用途、便攜、廉價(jià)的多肽質(zhì)譜儀是可行的,越來(lái)越多實(shí)驗室能夠負擔得起進(jìn)行非常重要的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的經(jīng)費。
來(lái)源:分析測試百科網(wǎng)